Структура управления Глобального договора ООН была утверждена 12 августа 2005 года Генеральным секретарем ООН Кофи Аннаном. Функции управления распределены между несколькими уровнями, что позволяет вовлекать участников и стейкхолдеров на глобальном и локальном уровнях в процессы принятия решений о наиболее важных вопросах развития ГД ООН и участия в нем. В 2017 году структура управления была пересмотрена в соответствии с Стратегией-2020 и Повесткой дня в области устойчивого развития до 2030 года.